乾隆二十三年（1758）三月，偕副都统巴图济尔噶勒自呼斯坦至尼勒喀河，侦珲齐等百余户游牧，突击，执之。四月，从师自伊犁逐剿诸回部。五月，至善塔斯岭，招降布鲁特头人涂鲁启拜、鄂库及其部众。九月，搜捕阿里玛涂河逸贼。十月，上以索伦兵从征久，召瑚尔起及副都统鄂博什率以还，瑚尔起等仍请从军。将军兆惠攻霍集占于叶尔羌，被围。定边右副将军富德檄瑚尔起及巴图济尔噶勒率索伦兵自伊拉里克赴援，以马驼未至，负粮械步行戈壁中。上奖谕，即授瑚尔起正白旗蒙古副都统，巴图济尔噶勒现任副都统，着加恩授其弟恩克阿穆尔为蓝翎侍卫。
乾隆二十四年（1759）正月，师至巴尔楚克，兆惠围已解，与富德军合。霍集占之徒阿卜都克勒木等入侵和阗，攻哈拉哈什，侍卫齐凌扎卜请援，兆惠令瑚尔起与巴图济尔噶勒督兵赴援。齐凌扎卜驰告，夜行至伊立齐，贼闻兵至，引退。三月，诇知贼骑七百馀屯博尔齐，天大雾，瑚尔起督兵突击，贼溃走，退至皂洼勒河，斩百余级，收回人四千馀户，和阗遂平。上赋博罗齐行纪事，赐瑚尔起云骑尉世职。七月，师自喀喇乌苏逐捕霍集占，至阿尔楚尔。贼设伏两山间，我军张两翼击之，贼败走三十里，负山而屯。瑚尔起等自山麓横冲入阵，师夹击，斩阿卜都克勒木，贼大败，越山遁，师从之，八月，至伊西洱库尔淖尔。瑚尔起等为伏东山，侧击，贼复大败，霍集占窜入巴达克山。巴达克山汗素勒坦沙献霍集占首。瑚尔起将索伦兵还。
乾隆二十五年（1760），赉银币，瑚尔起疏言：“呼伦贝尔多水泉，可耕。请选塔里雅沁降回百户往耕。”上命瑚尔起以副都统为呼伦贝尔总管，董其事。
乾隆二十六年（1761），图形紫光阁，列前五十功臣。御制赞曰：“突擒珲齐，其气如虹。及降勃律，乌幕占风。解围和阗，战鏖大食。麾鍪而登，威着西域。”
乾隆二十九年（1764），调任黑龙江副都统。
乾隆三十四年（1769），从征缅甸，收猛拱、猛养诸地。卒于军。赐骑都尉，并前世职为一等轻车都尉，祀昭忠祠。1
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